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Das Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft (BMEL) ist für die Agrarpolitik und die Lebensmittelsicherheit zuständig. Im Bereich der Lebensmittelsicherheit bereitet das BMEL Gesetzesentwürfe und Fragen zu Rechtsverordnungen vor. Unterstützt wird das BMEL von mehreren wissenschaftlichen Beiräten, z.B. für Agrarpolitik, Lebensmittel und gesundheitlichen Verbraucherschutz, Biodiversität und genetische Ressourcen. Zu den Einrichtungen im Geschäftsbereich des BMEL gehören Bundesoberbehörden, rechtlich selbstständige Einrichtungen, die Bundesforschungszentren, Einrichtungen der Leibniz-Gemeinschaft und Zuwendungsempfänger.

Das BMEL umfasst die nach Artikel 36 am EFSA-Netzwerk beteiligten Forschungseinrichtungen des Bundes, die zu verschiedenen Themen beraten. Dazu gehören das Friedrich-Loeffler-Institut (FLI) im Bereich der Tierseuchen, des Tierschutzes, der Tierhaltung, der Tierernährung und der Nutztiergenetik, das Julius Kühn-Institut (JKI) in Fragen der Pflanzengesundheit und des Pflanzenschutzes sowie das Max Rubner-Institut (MRI) im Bereich Ernährung und Lebensmittel. Darüber hinaus berät das Thünen-Institut (TI) als Teil des Artikel-36-Netzes in Fragen der Pflanzengesundheit, der gentechnisch veränderten Organismen, der Tiergesundheit und des Tierschutzes sowie der Umweltrisikobewertung.

Vierzehn nationale Referenzlaboratorien (NRL), die in den Bereichen Lebensmittel- und Futtermittelsicherheit sowie Lebensmittelhygiene tätig sind, sind dem BfR gemäß der Verordnung (EU) 2017/625 angeschlossen. Es handelt sich um NRLs für Salmonellen, Überwachung mariner Biotoxine, lebensmittelbedingte Viren, Listeria monocytogenes, koagulase-positive Staphylokokken einschließlich Staphylococcus aureus, Escherichia coli einschließlich Verotoxin-produzierender E. coli, Campylobacter, Trichinen, Antibiotikaresistenz, tierische Proteine in Futtermitteln, Zusatzstoffe zur Verwendung in der Tierernährung, Materialien, die mit Lebensmitteln in Berührung kommen, Mykotoxine und Pflanzentoxine in Futter- und Lebensmitteln sowie halogenierte persistente organische Schadstoffe (POPs) in Futter- und Lebensmitteln. Neben diesen auf EU-Recht basierenden NRLs sind dem BfR weitere Laboratorien mit Referenzfunktion angeschlossen. Dazu gehören das Referenzlabor im Netzwerk gentechnisch veränderter Organismen (GVO), die oberste Begutachtungsstelle für die Einfuhrkontrolle von Wein nach der Weinüberwachungsverordnung, die Zoonoseberichterstattung sowie die Konsiliarlaboratorien für Leptospira, Yersinia sowie Vibrios.

|[[File:AnimalFeed.png|Futtermittel|link=Animal feed|25px]] [[File:AnimalHealth.png|Tiergesundheit und Tierschutz|link=Animal health and welfare|25px]] [[File:BiologicalHazards.png|Biologische Gefahren und Zoonosen|link=Biological hazards and zoonoses|25px]] [[File:Biotechnology.png|Biotechnologie und Gentechnik|link=Biotechnology and genetic engineering|25px]] [[File:EmergingRisk.png|Neu auftretende Risiken|link=Emerging risk|25px]] [[File:ResiduesVeterinary.png|Tierarzneimittelrückstände|link=Residues of veterinary medicinal products|25px]]

|[[File:AnimalFeed.png|Futtermittel|link=Animal feed|25px]] [[File:Biotechnology.png|Biotechnologie und Gentechnik|link=Biotechnology and genetic engineering|25px]] [[File:Contaminants.png|Kontaminanten|link=Contaminants|25px]] [[File:DrinkingWater.png|Trinkwasser|link=Drinking water|25px]] [[File:EmergingRisk.png|Neu auftretende Risiken|link=Emerging risk|25px]] [[File:Environment.png|Umweltverträglichkeitsprüfung|link=Environmental risk assessment|25px]] [[File:FoodContactMaterials.png|Lebensmittelkontaktmaterialien und -verpackung|link=Food contact materials and packaging|25px]] [[File:FoodIngredients.png|Inhaltsstoffe|link=Food ingredients|25px]] [[File:Nanotechnology.png|Nanotechnologie|link=Nanotechnology|25px]] [[File:PlantHealth.png|Pflanzengesundheit|link=Plant health|25px]] [[File:PlantProtection.png|Pflanzenschutzmittel oder Pestizide|link=Plant protection products or pesticides|25px]]