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Im Bereich der Lebensmittel- und Futtermittelhygiene und der Einfuhrkontrollen arbeitet ALVA eng mit der Zollverwaltung zusammen. Für Inspektions- und Kontrolltätigkeiten gibt es gemeinsame Verfahren und Checklisten. ALVA ist auch für die Koordinierung der amtlichen Lebens- und Futtermittelkontrollen im Rahmen des mehrjährigen nationalen Kontrollplans (MANCP) zuständig. Es ist die Kontaktstelle für BTSF, RASFF, AAC, das Netzwerk für Lebensmittelbetrug und INFOSAN. ALVA stellt auch den nationalen Leiter der Lebensmittelsicherheitsagenturen (HoA).