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Le ministère de la Santé et de la Prévention (MSP), Direction générale de la santé (DGS), est en charge des politiques de santé publique. Le MSP définit les objectifs et priorités de la politique de santé publique, établit le cadre législatif et réglementaire, développe des plans de santé publique et des programmes de santé nationaux et garantit leur application. Au plan alimentaire, le MSP est en charge de la sécurité sanitaire de l'eau de boisson.  En collaboration avec le MASA, le MSP est chargé des investigations sur les maladies humaines d'origine alimentaire.